Sa capacité opérationnelle unique au sein des Forces Armées en Guyane (FAG), lui permet de remplir différentes missions de souveraineté et de protection fixées par le COMSUP.

La protection externe du centre spatial guyanais (CSG)

Un ordre permanent du COMSUP prévoit un dispositif évolutif de protection du CSG en fonction du niveau de menace et des activités du lanceur ARIANE. Cette mission nécessite des patrouilles de renseignement quotidiennes et le déploiement d'une compagnie et de moyens antiaériens durant 36 heures environ lors des lancements. Il s'agit d'une mission de contrôle de zone sur 900km², à base de postes de surveillance et de patrouilles.

L’affirmation de la souveraineté de la France

Surveillance de la frontière brésilienne

Le régiment déploie en permanence deux sections sur le fleuve OYAPOCK pour surveiller la frontière brésilienne. Ces sections effectuent des patrouilles en forêt et sur les fleuves, dans la profondeur du territoire guyanais, jusqu'à 50 kilomètres. Elles sont relevées tous les mois. Premier cercle du périmètre de protection du centre spatial, ce dispositif permet de marquer la présence française dans ce secteur tout en renseignant de façon permanente sur les activités d’orpaillage illégal et l’immigration clandestine.

Mission de présence

Il s'agit de renseigner et d'assurer la présence française dans des zones ciblées et d'accès particulièrement difficiles. Ces missions durent environ trois à quatre semaines. Les sections agissent en totale autonomie, bénéficiant à mi-parcours d'un ravitaillement conduit par voie aérienne. Seule la compagnie de combat permanente les assurent car elles nécessitent une réelle expertise dans le domaine de la vie en forêt équatoriale, un acclimatement avéré au territoire et une cohésion sans faille de la section.

Le soutien au service public

Dans le cadre de la participation des forces armées à la lutte contre l'immigration et l'orpaillage clandestins, les unités du 3e REI apportent un appui à la gendarmerie nationale chargée de l'exécution des procédures judiciaires. Le régiment agit dans le cadre de réquisitions administratives ou judiciaires, qui lui permettent d’apporter une aide à la gendarmerie ou aux autres services de l’Etat sans toutefois remplir des missions de police.

Les missions d’intervention

Le régiment est en mesure d'armer un EMT avec un noyau dur de la CCS et une compagnie de combat (la 2e compagnie). Le bataillon serait alors apte à intégrer jusqu'à 3 unités élémentaires venant des Antilles, de Guyane ou de métropole, pour intervenir dans la zone Antilles - Guyane ou sur le continent si la situation l’exigeait. En 2004, le 3e REI a fourni la 2e compagnie de combat en renfort au bataillon français engagé dans l'opération CARBET en Haïti.