Saint-Cyrien de la promotion général ROLLET, le général BOUQUIN a été affecté après une année à Montpellier, au 4ème Régiment étranger en 1980 puis au 2ème régiment étranger de parachutistes une année plus tard. Il y occupera successivement jusqu'en 1990 les fonctions de chef de section, d'officier adjoint, de commandant de compagnie puis d'officier traitant au bureau opérations instruction.

Après une année à l'état-major du 3ème corps, il intègre en 1991 l'école nationale supérieure des techniques avancées en tant que stagiaire du brevet technique de l'EMSST. Stagiaire en 1993 de la 107ème promotion du cours supérieur d'état-major, il rejoint un an plus tard, la 2ème promotion du collège interarmées de Défense (CID).

De 1995 à 2000, il sert successivement à l'état major des Armées (EMA) au bureau études puis à l'état-major des forces françaises stationnées à DJIBOUTI en tant que chef de la division opérations.

C'est en 2000 qu'il prend le commandement du 2ème régiment étranger de parachutistes. A l'issue de son temps de commandement, il rejoint le CID en qualité de chef de la cellule de simulation opérationnelle avant d'être auditeur de la 54ème promotion du CHEM et de la 57ème promotion de l'Institut des Hautes études de la Défense Nationale (IHEDN).

Avant de prendre le commandement de la Légion étrangère, le général BOUQUIN était affecté depuis 2005 à l'EMAT où il occupa en dernière année le poste de secrétaire général du conseil des systèmes de forces.

Général de brigade depuis le 1er août 2008, le général commandant la Légion étrangère a effectué de nombreuses opérations extérieures notamment au TCHAD et en République de CENTRAFRIQUE (1984, 1986, 1988 et 1989) ainsi qu'au KOSOVO en 2001.

Il est officier de la Légion d'honneur, officier de l'ordre national du mérite et titulaire entre autres décorations, de la croix de la valeur militaire avec étoile de bronze et de la croix du combattant.

Né en 1958, le général BOUQUIN est marié et père de six enfants.